免疫治療與標靶新藥百花齊放，許多癌症患者略過自費的基因診斷步驟，卻又苦於成效不彰；其實只要從FFPE腫瘤檢體取得完整癌細胞基因資訊，再難治的癌症，都有機會找對藥治療。

奇美醫院病理中心部長李健逢與台灣基因檢測公司行動基因合作，大規模的利用「廣泛型基因檢測」以次世代定序(NGS)分析來自各癌別的407件FFPE腫瘤檢體，獲得多種抗藥性以及影響免疫療法的基因突變資訊，建立起台灣首見的大型NGS本土資料庫，可造福需新藥試驗的患者。李健逢醫師指出，這證實了FFPE腫瘤檢體能作為醫院常規基因檢測，且透過精密的基因分析，有助患者聰明分配整體療程的醫藥費。

FFPE檢體具診斷優勢　美國NCCN指南推至第一線

李健逢醫師說明，FFPE將取出的腫瘤組織樣本，經福馬林固定製成石蠟包埋檢體，讓病理醫師削片染色診斷病情，是常規病理報告最常用的檢體，並有利保存進行研究。

針對FFPE和血液檢體的差異，他解釋，以FFPE檢體進行分析，更能直接從病變組織上找出問題來源，抽血檢測血中的循環腫瘤DNA(ctDNA)，則成為無法取得組織切片者的選擇，但仍有30%患者其ctDNA未在被癌細胞釋出到血液時被測得；美國NCCN肺癌腫瘤治療指引也建議，第一線治療以檢測FFPE檢體為主，不建議以血液切片取代。

癌症突變特性一覽無遺  從FFPE測TMB更助免疫治療  

FFPE在檢測前所需的優化作業有一定難度，而醫院多缺乏相關資源，因此對FFPE檢體是否能符合多基因檢測需求仍存疑。對此，李健逢醫師與台灣基因檢測公司行動基因合作，透過其具95%成功率的檢體優化技術，成功提升FFPE檢體中腫瘤細胞的比例，並利用「廣泛型基因檢測」以NGS分析407件FFPE檢體，發現台灣各類癌症患者除帶有多種抗藥性突變，更有與免疫治療相關的常見突變和特殊突變，證實優化後的FFPE檢體可成為癌症多基因檢測的首選。

針對患者是否適合免疫治療，李健逢醫師指出，目前強調腫瘤的PD-L1/PD-1或CTLA-4表現量高，是為確認腫瘤有藉由該機轉躲避免疫細胞辨認的工具，並以單株抗體抑制PD-L1/PD-1等抗原，阻斷腫瘤細胞逃脫免疫辨識的機會，但單獨PD-L1/PD-1並非可靠因子，「有些並未表現出PD-L1/PD-1的患者，治療仍有效；有些表現出來的患者，治療卻無效。」形成免疫治療在精準度上的盲區。

「要能從免疫治療獲益，關鍵在於阻斷腫瘤細胞逃脫免疫辨識的機會後，免疫細胞能否認出癌細胞，進而將之消滅。」他強調，若癌細胞突變產生可被免疫系統辨識的抗原（neoantigen）越多，被免疫細胞認出的機率越高。近來研究顯示，代表腫瘤有多少抗原突變的「腫瘤突變負荷量」(tumor mutational burden, TMB)成為免疫治療的關鍵指標，將PD-L1/PD-1和TMB共同評估的精準度更佳，若兩指數都很高，免疫治療可更有成效。

特定癌別TMB在台灣與國外大不同　誰適合免疫治療更需檢測

本次研究發現，與紀念斯隆—凱特琳癌症中心(MSKCC)、美國癌症基因體圖譜計畫TCGA等資料庫比較，台灣肺癌的TMB平均較低，另外台灣食道癌以鱗狀上皮細胞癌為主，與美國較常見腺癌不同，其TMB也較低。其他種類癌症也存在細微但無法忽略的差異。李健逢醫師說，這可能可以解釋為何台灣和國外相同癌症的免疫治療效果不同。

在407個檢體中，也發現家族性遺傳乳癌病患，可能會將致癌基因遺傳給小孩，因此可先進行遺傳篩檢提早預防。另外，也有神經內分泌瘤復發的患者，發現其TMB高，進行免疫治療後，無法切除的腫瘤都消失了。

李健逢醫師提到，這次透過「廣泛型基因分析」的407個案例分布各類型腫瘤，未來須針對特定癌症含括更多樣本，並公開給各藥廠，為台灣患者爭取新藥試驗的機會。